1、首先，两者从本质上讲是没有区别的，都是进行司法鉴定的机构，只是设立单位从机构设置的角度上有细微差别。

2、一般有背景的的单位下边成立个编制就叫中心，单独成立的一般叫所。

3、鉴定中心是指实力和规模较大、覆盖服务社区较大、鉴定项目在5个（含5个）以上大类的司法鉴定机构才可以称为“中心”。比如含：法医临床、法医病理、法医物证、建筑工程、文书痕迹、会计等就可以称为“中心。实力和规模一般，服务覆盖面小、鉴定项目在1~4个内就只能称为“所。